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Clustering complex networks and biological networks by nonnegative matrix factorization with various similarity measures 期刊论文
NEUROCOMPUTING, 2008, 卷号: 72, 期号: 1-3, 页码: 134-141
作者:  Wang, Rui-Sheng;  Zhang, Shihua;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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Complex networks  Biological networks  Community structure  Nonnegative matrix factorization  Similarity measure  
Recognition of Structure Similarities in Proteins 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2008, 卷号: 21, 期号: 4, 页码: 665-675
作者:  Wang, Lin;  Qiu, Yuqing;  Wang, Jiguang;  Zhang, Xiangsun
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Binding site alignment  circular permutations  flexible alignment  protein structure alignment  protein structure retrieval  
Remarks on Network Community Properties 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2008, 卷号: 21, 期号: 4, 页码: 637-644
作者:  Wang, Jiguang;  Qiu, Yuqing;  Wang, Ruisheng;  Zhang, Xiangsun
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Community  complex network  modularity  modularity density  
Bridging protein local structures and protein functions 期刊论文
AMINO ACIDS, 2008, 卷号: 35, 期号: 3, 页码: 627-650
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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functional genomics  functional motifs  local structures  protein function prediction  
The knowledge-integrated network biomarkers discovery for Major Adverse Cardiac Events 期刊论文
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 2008, 卷号: 7, 期号: 9, 页码: 4013-4021
作者:  Jin, Guangxu;  Zhou, Xiaobo;  Wang, Honghui;  Zhao, Hong;  Cui, Kemi;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan;  Hazen, Stanley L.;  Li, King;  Wong, Stephen T. C.
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proteomics  mass spectrometry  MACE  network biomarker  cross validation  systems biology  
A fast haplotype inference method for large population genotype data 期刊论文
COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, 2008, 卷号: 52, 期号: 11, 页码: 4891-4902
作者:  Zhang, Ji-Hong;  Wu, Ling-Yun;  Chen, Jian;  Zhang, Xiang-Sun
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Analysis of protein surface patterns by pocket similarity network 期刊论文
PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, 2008, 卷号: 15, 期号: 5, 页码: 448-455
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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protein surface pattern  pocket similarity  complex network  functional genomics  systems biology  
Quantitative function for community detection 期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2008, 卷号: 77, 期号: 3, 页码: 9
作者:  Li, Zhenping;  Zhang, Shihua;  Wang, Rui-Sheng;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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Biomolecular network querying: a promising approach in systems biology 期刊论文
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2008, 卷号: 2, 页码: 6
作者:  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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中国全要素生产率分析：Malmquist指数法评述与应用 期刊论文
数量经济技术经济研究, 2008, 卷号: 025, 期号: 006, 页码: 111
作者:  章祥荪;  贵斌威
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