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Annotating regulatory elements by heterogeneous network embedding 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 13
作者:  Lu, Yurun;  Feng, Zhanying;  Zhang, Songmao;  Wang, Yong
收藏  |  浏览/下载：143/0  |  提交时间：2022/06/21
Importance-Penalized Joint Graphical Lasso (IPJGL): differential network inference via GGMs 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 3, 页码: 770-777
作者:  Leng, Jiacheng;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：150/0  |  提交时间：2022/04/02
RobustClone: a robust PCA method for tumor clone and evolution inference from single-cell sequencing data 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 36, 期号: 11, 页码: 3299-3306
作者:  Chen, Ziwei;  Gong, Fuzhou;  Wan, Lin;  Ma, Liang
收藏  |  浏览/下载：177/0  |  提交时间：2020/09/23
scTIM: seeking cell-type-indicative marker from single cell RNA-seq data by consensus optimization 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 36, 期号: 8, 页码: 2474-2485
作者:  Feng, Zhanying;  Ren, Xianwen;  Fang, Yuan;  Yin, Yining;  Huang, Chutian;  Zhao, Yimin;  Wang, Yong
收藏  |  浏览/下载：189/0  |  提交时间：2020/06/30
Edge-group sparse PCA for network-guided high dimensional data analysis 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 34, 期号: 20, 页码: 3479-3487
作者:  Min, Wenwen;  Liu, Juan;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：194/0  |  提交时间：2019/01/11
DrugE-Rank: improving drug-target interaction prediction of new candidate drugs or targets by ensemble learning to rank 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2016, 卷号: 32, 期号: 12, 页码: 18-27
作者:  Yuan, Qingjun;  Gao, Junning;  Wu, Dongliang;  Zhang, Shihua;  Mamitsuka, Hiroshi;  Zhu, Shanfeng
收藏  |  浏览/下载：138/0  |  提交时间：2018/07/30
Integrative analysis for identifying joint modular patterns of gene-expression and drug-response data 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2016, 卷号: 32, 期号: 11, 页码: 1724-1732
作者:  Chen, Jinyu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：146/0  |  提交时间：2018/07/30
Computational probing protein-protein interactions targeting small molecules 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2016, 卷号: 32, 期号: 2, 页码: 226-234
作者:  Wang, Yong-Cui;  Chen, Shi-Long;  Deng, Nai-Yang;  Wang, Yong
收藏  |  浏览/下载：136/0  |  提交时间：2018/07/30
An efficient network querying method based on conditional random fields 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2011, 卷号: 27, 期号: 22, 页码: 3173-3178
作者:  Huang, Qiang;  Wu, Ling-Yun;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：131/0  |  提交时间：2018/07/30
A novel computational framework for simultaneous integration of multiple types of genomic data to identify microRNA-gene regulatory modules 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2011, 卷号: 27, 期号: 13, 页码: I401-I409
作者:  Zhang, Shihua;  Li, Qingjiao;  Liu, Juan;  Zhou, Xianghong Jasmine
收藏  |  浏览/下载：151/0  |  提交时间：2018/07/30