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NetGen: a novel network-based probabilistic generative model for gene set functional enrichment analysis 期刊论文
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2017, 卷号: 11, 页码: 14
作者:  Sun, Duanchen;  Liu, Yinliang;  Zhang, Xiang-Sun;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：135/0  |  提交时间：2018/07/30
Gene ontology  Enrichment analysis  Network-based probabilistic generative model  Integer programming  Complex diseases  
A unified computational model for revealing and predicting subtle subtypes of cancers 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2012, 卷号: 13, 期号: 1
作者:  Ren,Xianwen;  Wang,Yong;  Wang,Jiguang;  Zhang,Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：143/0  |  提交时间：2018/07/30
Class discovery  Class prediction  Quadratic programming  Cancer  
Rewiring drug-activated p53-regulatory network from suppressing to promoting tumorigenesis 期刊论文
Journal of Molecular Cell Biology, 2012, 卷号: 4, 期号: 4, 页码: 197
作者:  Wei Song;  Wang Jiguang;  Ying Yang;  Jing Naihe;  Xiangsun Zhang;  Chen Luonan;  Wu Jiarui
收藏  |  浏览/下载：133/0  |  提交时间：2020/01/10
Detecting and analyzing differentially activated pathways in brain regions of Alzheimer's disease patients 期刊论文
MOLECULAR BIOSYSTEMS, 2011, 卷号: 7, 期号: 5, 页码: 1441-1452
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Xia, Weiming;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：139/0  |  提交时间：2018/07/30
A linear programming model based on network flow for pathway inference 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2010, 卷号: 23, 期号: 5, 页码: 971-977
作者:  Ren, Xianwen;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：104/0  |  提交时间：2018/07/30
Gene expression  linear programming  network flow  pathway inference  protein interaction network  
Detecting disease associated modules and prioritizing active genes based on high throughput data 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2010, 卷号: 11, 页码: 12
作者:  Qiu, Yu-Qing;  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：135/0  |  提交时间：2018/07/30
Binary matrix factorization for analyzing gene expression data 期刊论文
DATA MINING AND KNOWLEDGE DISCOVERY, 2010, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 28-52
作者:  Zhang, Zhong-Yuan;  Li, Tao;  Ding, Chris;  Ren, Xian-Wen;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：112/0  |  提交时间：2018/07/30
Biclustering  Non-negative matrix factorization  Boundedness property of NMF  Binary matrix  
Identifying differentially expressed pathways via a mixed integer linear programming model 期刊论文
IET SYSTEMS BIOLOGY, 2009, 卷号: 3, 期号: 6, 页码: 475-486
作者:  Qiu, Y-Q.;  Zhang, S.;  Zhang, X. -S.;  Chen, L.
收藏  |  浏览/下载：97/0  |  提交时间：2018/07/30
A Network Biology Study on Circadian Rhythm by Integrating Various Omics Data 期刊论文
OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY, 2009, 卷号: 13, 期号: 4, 页码: 313-324
作者:  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：129/0  |  提交时间：2018/07/30
Modeling post-transcriptional regulation activity of small non-coding RNAs in Escherichia coli 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2009, 卷号: 10, 期号: Suppl 4
作者:  Wang,Rui-Sheng;  Jin,Guangxu;  Zhang,Xiang-Sun;  Chen,Luonan
收藏  |  浏览/下载：114/0  |  提交时间：2018/07/30