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Probe Efficient Feature Representation of Gapped K-mer Frequency Vectors from Sequences Using Deep Neural Networks 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 17, 期号: 2, 页码: 657-667
作者:  Cao, Zhen;  Zhang, Shihua
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DNA  Bioinformatics  Kernel  Feature extraction  Support vector machines  Genomics  Task analysis  Bioinformatics  machine learning  gapped k-mer  deep neural network  transcription factor binding site prediction  
Comparative pan-cancer DNA methylation analysis reveals cancer common and specific patterns 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 18, 期号: 5, 页码: 761-773
作者:  Yang, Xiaofei;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
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cancer genomics  DNA-methylation  pan-cancer study  bioinformatics  
Comparative DNA methylation analysis to decipher common and cell type-specific patterns among multiple cell types 期刊论文
BRIEFINGS IN FUNCTIONAL GENOMICS, 2016, 卷号: 15, 期号: 6, 页码: 399-407
作者:  Yang, Xiaofei;  Shao, Xiaojian;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：181/0  |  提交时间：2018/07/30
DNA methylation patterns  differentially methylation regions  comparative studies  tissue-specific methylation  cancer epigenomics