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NOA: a novel Network Ontology Analysis method 期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2011, 卷号: 39, 期号: 13, 页码: 12
作者:  Wang, Jiguang;  Huang, Qiang;  Liu, Zhi-Ping;  Wang, Yong;  Wu, Ling-Yun;  Chen, Luonan;  Zhang, Xiang-Sun
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SANA: an algorithm for sequential and non-sequential protein structure alignment 期刊论文
AMINO ACIDS, 2010, 卷号: 39, 期号: 2, 页码: 417-425
作者:  Wang, Lin;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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Protein structure alignment  Fold comparison  Circular permutation  Functional sites  
Prediction of protein-RNA binding sites by a random forest method with combined features 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2010, 卷号: 26, 期号: 13, 页码: 1616-1622
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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Evaluating Protein Similarity from Coarse Structures 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2009, 卷号: 6, 期号: 4, 页码: 583-593
作者:  Wang, Yong;  Wu, Ling-Yun;  Zhang, Ji-Hong;  Zhan, Zhong-Wei;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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Protein structure  structure comparison  protein surface  
Modularity optimization in community detection of complex networks 期刊论文
EPL, 2009, 卷号: 87, 期号: 3, 页码: 6
作者:  Zhang, X. S.;  Wang, R. S.;  Wang, Y.;  Wang, J.;  Qiu, Y.;  Wang, L.;  Chen, L.
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Modularity optimization in community detection of complex networks (vol 87, pg 38002, 2009) 期刊论文
EPL, 2009, 卷号: 87, 期号: 4, 页码: 1
作者:  Zhang, X. S.;  Wang, R. S.;  Wang, Y.;  Wang, J.;  Qiu, Y.;  Wang, L.;  Chen, L.
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Self-organizing map approaches for the haplotype assembly problem 期刊论文
MATHEMATICS AND COMPUTERS IN SIMULATION, 2009, 卷号: 79, 期号: 10, 页码: 3026-3037
作者:  Wu, Ling-Yun;  Li, Zhenping;  Wang, Rui-Sheng;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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SNP  Haplotype assembly  Minimum error correction  Self-organizing maps  Neural network  
Bridging protein local structures and protein functions 期刊论文
AMINO ACIDS, 2008, 卷号: 35, 期号: 3, 页码: 627-650
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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functional genomics  functional motifs  local structures  protein function prediction  
A fast haplotype inference method for large population genotype data 期刊论文
COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, 2008, 卷号: 52, 期号: 11, 页码: 4891-4902
作者:  Zhang, Ji-Hong;  Wu, Ling-Yun;  Chen, Jian;  Zhang, Xiang-Sun
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Analysis of protein surface patterns by pocket similarity network 期刊论文
PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, 2008, 卷号: 15, 期号: 5, 页码: 448-455
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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protein surface pattern  pocket similarity  complex network  functional genomics  systems biology