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Computational probing protein-protein interactions targeting small molecules 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2016, 卷号: 32, 期号: 2, 页码: 226-234
作者:  Wang, Yong-Cui;  Chen, Shi-Long;  Deng, Nai-Yang;  Wang, Yong
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iSuc-PseAAC: predicting lysine succinylation in proteins by incorporating peptide position-specific propensity 期刊论文
SCIENTIFIC REPORTS, 2015, 卷号: 5, 页码: 6
作者:  Xu, Yan;  Ding, Ya-Xin;  Ding, Jun;  Lei, Ya-Hui;  Wu, Ling-Yun;  Deng, Nai-Yang
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Kernel-based data fusion improves the drug-protein interaction prediction 期刊论文
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, 2011, 卷号: 35, 期号: 6, 页码: 353-362
作者:  Wang, Yong-Cui;  Zhang, Chun-Hua;  Deng, Nai-Yang;  Wang, Yong
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Drug-target interaction  Chemical space  Pharmacological space  Therapeutic space  Genomic space  Kernel function  Support vector machine  
Support vector machine prediction of enzyme function with conjoint triad feature and hierarchical context 期刊论文
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2011, 卷号: 5, 页码: 11
作者:  Wang, Yong-Cui;  Wang, Yong;  Yang, Zhi-Xia;  Deng, Nai-Yang
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Computationally Probing Drug-Protein Interactions Via Support Vector Machine 期刊论文
LETTERS IN DRUG DESIGN & DISCOVERY, 2010, 卷号: 7, 期号: 5, 页码: 370-378
作者:  Wang, Yong-Cui;  Yang, Zhi-Xia;  Wang, Yong;  Deng, Nai-Yang
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Drug-target interaction  Chemical structure  Protein sequence  Imbalance problem  Support vector machine  
Lysine acetylation sites prediction using an ensemble of support vector machine classifiers 期刊论文
JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, 2010, 卷号: 264, 期号: 1, 页码: 130-135
作者:  Xu, Yan;  Wang, Xiao-Bo;  Ding, Jun;  Wu, Ling-Yun;  Deng, Nai-Yang
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Bioinformatics  Acetylated proteins  Ensemble  SVM  PWMs  EnsemblePail  
Prediction of palmitoylation sites using the composition of k-spaced amino acid pairs 期刊论文
PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION, 2009, 卷号: 22, 期号: 11, 页码: 707-712
作者:  Wang, Xiao-Bo;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong-Cui;  Deng, Nai-Yang
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CKSAAP-Palm  palmitoylated proteins  palmitoylation  support vector machine