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VP-Detector: A 3D multi-scale dense convolutional neural network for macromolecule localization and classification in cryo-electron tomograms 期刊论文
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE, 2022, 卷号: 221, 页码: 14
作者:  Hao, Yu;  Wan, Xiaohua;  Yan, Rui;  Liu, Zhiyong;  Li, Jintao;  Zhang, Shihua;  Cui, Xuefeng;  Zhang, Fa
收藏  |  浏览/下载：121/0  |  提交时间：2023/02/07
Cryo-ET  Sub-tomogram averaging  Particle localization  Particle classification  Convolutional neural networks  
Comparison of Computational Methods for Imputing Single-Cell RNA-Sequencing Data 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 17, 期号: 2, 页码: 376-389
作者:  Zhang, Lihua;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：169/0  |  提交时间：2020/05/24
Gene expression  Sequential analysis  Bioinformatics  RNA  Matrix converters  Computational biology  Bayes methods  Single-cell RNA-sequencing technique  dropout event  imputation  algorithm  bioinformatics  
Large-scale determination and characterization of cell type-specific regulatory elements in the human genome 期刊论文
Journal of Molecular Cell Biology, 2017, 卷号: 9, 期号: 6, 页码: 463
作者:  Wang Can;  Zhang Shihua
收藏  |  浏览/下载：144/0  |  提交时间：2018/07/30
Quantitative function and algorithm for community detection in bipartite networks 期刊论文
INFORMATION SCIENCES, 2016, 卷号: 367, 页码: 874-889
作者:  Li, Zhenping;  Wang, Rui-Sheng;  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：176/0  |  提交时间：2018/07/30
Bipartite network  Community  Quantitative function  Integer programming  Label propagation algorithm  
Tumor characterization and stratification by integrated molecular profiles reveals essential pan-cancer features 期刊论文
BMC GENOMICS, 2015, 卷号: 16, 页码: 12
作者:  Liu, Zhaoqi;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：147/0  |  提交时间：2018/07/30