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BiTSC2: Bayesian inference of tumor clonal tree by joint analysis of single-cell SNV and CNA data 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 12
作者:  Chen, Ziwei;  Gong, Fuzhou;  Wan, Lin;  Ma, Liang
收藏  |  浏览/下载：172/0  |  提交时间：2022/06/21
single-cell DNA sequencing  intra-tumor heterogeneity  single nucleotide variation  copy number alteration  Bayesian modeling  cancer evolution  
The Asymptotic Behavior of Bootstrap Support Values in Molecular Phylogenetics 期刊论文
SYSTEMATIC BIOLOGY, 2021, 卷号: 70, 期号: 4, 页码: 774-785
作者:  Huang, Jun;  Liu, Yuting;  Zhu, Tianqi;  Yang, Ziheng
收藏  |  浏览/下载：139/0  |  提交时间：2021/10/26
Bootstrap  model selection  star-tree paradox  support value  
Bayesian Joint Matrix Decomposition for Data Integration with Heterogeneous Noise 期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON PATTERN ANALYSIS AND MACHINE INTELLIGENCE, 2021, 卷号: 43, 期号: 4, 页码: 1184-1196
作者:  Zhang, Chihao;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：188/0  |  提交时间：2021/04/26
Matrix decomposition  Bayes methods  Data integration  Inference algorithms  Data models  Data mining  Gaussian distribution  Bayesian methods  matrix decomposition  data integration  variational Bayesian inference  maximum a posterior  
The Spectre of Too Many Species 期刊论文
SYSTEMATIC BIOLOGY, 2019, 卷号: 68, 期号: 1, 页码: 168-181
作者:  Leache, Adam D.;  Zhu, Tianqi;  Rannala, Bruce;  Yang, Ziheng
收藏  |  浏览/下载：210/0  |  提交时间：2020/01/10
bpp  multispecies coalescent  Species delimitation  taxonomy  
MSIQ: JOINT MODELING OF MULTIPLE RNA-SEQ SAMPLES FOR ACCURATE ISOFORM QUANTIFICATION 期刊论文
ANNALS OF APPLIED STATISTICS, 2018, 卷号: 12, 期号: 1, 页码: 510-539
作者:  Li, Wei Vivian;  Zhao, Anqi;  Zhang, Shihua;  Li, Jingyi Jessica
收藏  |  浏览/下载：195/0  |  提交时间：2018/07/30
Isoform abundance estimation  joint inference from multiple samples  RNA sequencing  Bayesian hierarchical models  Gibbs sampling  data heterogeneity