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Structure alignment-based classification of RNA-binding pockets reveals regional RNA recognition motifs on protein surfaces 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 18, 页码: 13
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Liu, Shutang;  Chen, Ruitang;  Huang, Xiaopeng;  Wu, Ling-Yun
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RNA-binding pocket  Local structure classification  Structural alignment  Network clustering  Structure motif  
An effective sequence-alignment-free superpositioning of pairwise or multiple structures with missing data 期刊论文
Algorithms for Molecular Biology, 2016, 卷号: 11, 期号: 1
作者:  Lu,Jianbo;  Xu,Guoliang;  Zhang,Shihua;  Lu,Benzhuo
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Superposition  Protein structure alignment  Iterative closest point  
Corbi: a new R package for biological network alignment and querying 期刊论文
BMC Systems Biology, 2013, 卷号: 7, 期号: Suppl 2
作者:  Huang,Qiang;  Wu,Ling-Yun;  Zhang,Xiang-Sun
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Recognition of Structure Similarities in Proteins 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2008, 卷号: 21, 期号: 4, 页码: 665-675
作者:  Wang, Lin;  Qiu, Yuqing;  Wang, Jiguang;  Zhang, Xiangsun
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Binding site alignment  circular permutations  flexible alignment  protein structure alignment  protein structure retrieval  
Revealing divergent evolution, identifying circular permutations and detecting active-sites by protein structure comparison 期刊论文
BMC STRUCTURAL BIOLOGY, 2006, 卷号: 6, 页码: 14
作者:  Chen, Luonan;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun
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