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Extended particle swarm optimisation method for folding protein on triangular lattice 期刊论文
IET SYSTEMS BIOLOGY, 2016, 卷号: 10, 期号: 1, 页码: 30-33
作者:  Guo, Yuzhen;  Wu, Zikai;  Wang, Ying;  Wang, Yong
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proteins  molecular biophysics  molecular configurations  particle swarm optimisation  bioinformatics  extended particle swarm optimisation method  triangular lattice  protein structure prediction problem  two-dimensional hydrophobic-polar model  noncompact conformation  amino acid sequence  single point adjustment strategy  protein folding  
Optimal HP configurations of proteins by combining local search with elastic net algorithm 期刊论文
JOURNAL OF BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL METHODS, 2007, 卷号: 70, 期号: 3, 页码: 335-340
作者:  Guo, Yu-Zhen;  Feng, En-Min;  Wang, Yong
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protein folding problem  2D HP lattice model  elastic net algorithm  local search method  
Quasi-physical algorithm for protein folding in an off-lattice model 期刊论文
COMMUNICATIONS IN THEORETICAL PHYSICS, 2007, 卷号: 47, 期号: 1, 页码: 181-185
作者:  Lu Zhi-Peng;  Huang Wen-Qi;  Shi He
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quasi-physical algorithm  conjugate gradient method  protein folding  off-lattice model