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Hybrid method to solve HP model on 3D lattice and to probe protein stability upon amino acid mutations 期刊论文
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2017, 卷号: 11, 页码: 13
作者:  Guo, Yuzhen;  Tao, Fengying;  Wu, Zikai;  Wang, Yong
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Protein structure prediction  HP model  3D lattice  Particle swarm optimization  Protein stability  
Extended particle swarm optimisation method for folding protein on triangular lattice 期刊论文
IET SYSTEMS BIOLOGY, 2016, 卷号: 10, 期号: 1, 页码: 30-33
作者:  Guo, Yuzhen;  Wu, Zikai;  Wang, Ying;  Wang, Yong
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proteins  molecular biophysics  molecular configurations  particle swarm optimisation  bioinformatics  extended particle swarm optimisation method  triangular lattice  protein structure prediction problem  two-dimensional hydrophobic-polar model  noncompact conformation  amino acid sequence  single point adjustment strategy  protein folding  
Optimal HP configurations of proteins by combining local search with elastic net algorithm 期刊论文
JOURNAL OF BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL METHODS, 2007, 卷号: 70, 期号: 3, 页码: 335-340
作者:  Guo, Yu-Zhen;  Feng, En-Min;  Wang, Yong
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protein folding problem  2D HP lattice model  elastic net algorithm  local search method  
Quasi-physical algorithm for protein folding in an off-lattice model 期刊论文
COMMUNICATIONS IN THEORETICAL PHYSICS, 2007, 卷号: 47, 期号: 1, 页码: 181-185
作者:  Lu Zhi-Peng;  Huang Wen-Qi;  Shi He
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quasi-physical algorithm  conjugate gradient method  protein folding  off-lattice model  
Exploration of two-dimensional hydrophobic-polar lattice model by combining local search with elastic net algorithm 期刊论文
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 2006, 卷号: 125, 期号: 15, 页码: 6
作者:  Guo, Yu-Zhen;  Feng, En-Min;  Wang, Yong
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改进的自组织映射（SOM）蛋白质折叠算法和计算实现 期刊论文
系统科学与数学, 2005, 卷号: 25.0, 期号: 005, 页码: 562-573
作者:  王勇;  詹钟炜;  吴凌云;  章祥荪
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自组织映射  蛋白质折叠算法  HP模型  搜索算法  迭代步数