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Edge-group sparse PCA for network-guided high dimensional data analysis 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 34, 期号: 20, 页码: 3479-3487
作者:  Min, Wenwen;  Liu, Juan;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：194/0  |  提交时间：2019/01/11
CEA: Combination-based gene set functional enrichment analysis 期刊论文
SCIENTIFIC REPORTS, 2018, 卷号: 8, 页码: 13
作者:  Sun, Duanchen;  Liu, Yinliang;  Zhang, Xiang-Sun;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：263/0  |  提交时间：2018/10/07
BAUM: improving genome assembly by adaptive unique mapping and local overlap-layout-consensus approach 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 34, 期号: 12, 页码: 2019-2028
作者:  Wang, Anqi;  Wang, Zhanyu;  Li, Zheng;  Li, Lei M.
收藏  |  浏览/下载：162/0  |  提交时间：2018/07/30
Matrix Integrative Analysis (MIA) of Multiple Genomic Data for Modular Patterns 期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2018, 卷号: 9, 页码: 12
作者:  Chen, Jinyu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：184/0  |  提交时间：2018/07/30
bioinformatics  multi-dimensional genomics  matrix integrative analysis  data integration  module discovery  non-negative matrix factorization (NMF)  partial least squares (PLS)  
Network-Regularized Sparse Logistic Regression Models for Clinical Risk Prediction and Biomarker Discovery 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 15, 期号: 3, 页码: 944-953
作者:  Min, Wenwen;  Liu, Juan;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：257/0  |  提交时间：2018/07/30
Sparse logistic regression  network-regularized penalty  survival risk prediction  feature selection  
The Discovery of Mutated Driver Pathways in Cancer: Models and Algorithms 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 15, 期号: 3, 页码: 988-998
作者:  Zhang, Junhua;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：219/0  |  提交时间：2018/07/30
Bioinformatics  cancer genomics  driver gene  driver pathway  mutual exclusivity  co-occurring mutation