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Comparative DNA methylation analysis to decipher common and cell type-specific patterns among multiple cell types 期刊论文
BRIEFINGS IN FUNCTIONAL GENOMICS, 2016, 卷号: 15, 期号: 6, 页码: 399-407
作者:  Yang, Xiaofei;  Shao, Xiaojian;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
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DNA methylation patterns  differentially methylation regions  comparative studies  tissue-specific methylation  cancer epigenomics  
An integrative and comparative study of pan-cancer transcriptomes reveals distinct cancer common and specific signatures 期刊论文
SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 卷号: 6, 页码: 13
作者:  Cao, Zhen;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：135/0  |  提交时间：2018/07/30
A Two-Stage Method to Identify Joint Modules From Matched MicroRNA and mRNA Expression Data 期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 2016, 卷号: 15, 期号: 4, 页码: 362-370
作者:  Min, Wenwen;  Liu, Juan;  Luo, Fei;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：174/0  |  提交时间：2018/07/30
L-0-penalized singular value decomposition (L-0-SVD)  miRNA cluster  miRNA-gene joint module  multiple-output sparse group lasso