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EFFICIENT AND QUALIFIED MESH GENERATION FOR GAUSSIAN MOLECULAR SURFACE USING ADAPTIVE PARTITION AND PIECEWISE POLYNOMIAL APPROXIMATION 期刊论文
SIAM JOURNAL ON SCIENTIFIC COMPUTING, 2018, 卷号: 40, 期号: 2, 页码: B507-B527
作者:  Liu, Tiantian;  Chen, Minxin;  Lu, Benzhuo
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surface mesh generation  Gaussian surface  triangulation  adaptive partition  trilinear polynomial  
Incorporating Born solvation energy into the three-dimensional Poisson-Nernst-Planck model to study ion selectivity in KcsA K+ channels 期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2017, 卷号: 96, 期号: 6, 页码: 10
作者:  Liu, Xuejiao;  Lu, Benzhuo
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A Local Approximation of Fundamental Measure Theory Incorporated into Three Dimensional Poisson-Nernst-Planck Equations to Account for Hard Sphere Repulsion Among Ions 期刊论文
JOURNAL OF STATISTICAL PHYSICS, 2016, 卷号: 163, 期号: 1, 页码: 156-174
作者:  Qiao, Yu;  Liu, Xuejiao;  Chen, Minxin;  Lu, Benzhuo
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Hard sphere repulsion  Three dimensional fundamental measure theory  Poisson-Nernst-Planck equations  Size-modified PNP  Equation of state  
Automated Parallel and Body-Fitted Mesh Generation in Finite Element Simulation of Macromolecular Systems 期刊论文
COMMUNICATIONS IN COMPUTATIONAL PHYSICS, 2016, 卷号: 19, 期号: 3, 页码: 582-602
作者:  Xie, Yan;  Liu, Tiantian;  Tu, Bin;  Lu, Benzhuo;  Zhang, Linbo
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Parallel mesh generation  body-fitted  PHG  biomolecules  finite element simulation  
Continuum electromechanical modeling of protein-membrane interactions 期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2010, 卷号: 82, 期号: 4, 页码: 5
作者:  Zhou, Y. C.;  Lu, Benzhuo;  Gorfe, Alemayehu A.
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A computational study of ion conductance in the KcsA K+ channel using a Nernst-Planck model with explicit resident ions 期刊论文
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 2009, 卷号: 131, 期号: 21, 页码: 10
作者:  Jung, Yong-Woon;  Lu, Benzhuo;  Mascagni, Michael
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