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A Time-Dependent Finite Element Algorithm for Simulations of Ion Current Rectification and Hysteresis Properties of 3D Nanopore System 期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON NANOTECHNOLOGY, 2018, 卷号: 17, 期号: 3, 页码: 513-519
作者:  Xu, Jingjie;  Lu, Benzhuo;  Zhang, Linbo
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3D nanopore  analytical test  backward Euler  FEM  ICR  numerical simulation  PNP equations  varying voltage  
ANALYSIS OF THE MEAN FIELD FREE ENERGY FUNCTIONAL OF ELECTROLYTE SOLUTION WITH NONHOMOGENOUS BOUNDARY CONDITIONS AND THE GENERALIZED PB/PNP EQUATIONS WITH INHOMOGENEOUS DIELECTRIC PERMITTIVITY 期刊论文
SIAM JOURNAL ON APPLIED MATHEMATICS, 2018, 卷号: 78, 期号: 2, 页码: 1131-1154
作者:  Liu, Xuejiao;  Qiao, Yu;  Lu, Benzhou
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free energy functional  electrolyte  boundary conditions  variable dielectric  generalized Poisson-Nernst-Planck/Poisson-Boltzmann equations  energy law  
MODIFIED POISSON-NERNST-PLANCK MODEL WITH ACCURATE COULOMB CORRELATION IN VARIABLE MEDIA 期刊论文
SIAM JOURNAL ON APPLIED MATHEMATICS, 2018, 卷号: 78, 期号: 1, 页码: 226-245
作者:  Liu, Pei;  Ji, Xia;  Xu, Zhenli
收藏  |  浏览/下载：176/0  |  提交时间：2018/07/30
charge transport  ion correlation  continuum theory for electrostatics  asymptotic expansion  Green's function  Poisson-Nernst-Planck equations  
Incorporating Born solvation energy into the three-dimensional Poisson-Nernst-Planck model to study ion selectivity in KcsA K+ channels 期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2017, 卷号: 96, 期号: 6, 页码: 10
作者:  Liu, Xuejiao;  Lu, Benzhuo
收藏  |  浏览/下载：160/0  |  提交时间：2018/07/30
Charged Substrate and Product Together Contribute Like a Nonreactive Species to the Overall Electrostatic Steering in Diffusion-Reaction Processes 期刊论文
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 2016, 卷号: 120, 期号: 33, 页码: 8147-8153
作者:  Xu, Jingjie;  Xie, Yan;  Lu, Benzhuo;  Zhang, Linbo
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A Local Approximation of Fundamental Measure Theory Incorporated into Three Dimensional Poisson-Nernst-Planck Equations to Account for Hard Sphere Repulsion Among Ions 期刊论文
JOURNAL OF STATISTICAL PHYSICS, 2016, 卷号: 163, 期号: 1, 页码: 156-174
作者:  Qiao, Yu;  Liu, Xuejiao;  Chen, Minxin;  Lu, Benzhuo
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Hard sphere repulsion  Three dimensional fundamental measure theory  Poisson-Nernst-Planck equations  Size-modified PNP  Equation of state  
improvementsincontinuummodelingforbiomolecularsystems 期刊论文
chinesephysicsb, 2016, 卷号: 25, 期号: 1
作者:  Qiao Yu;  Lu Benzhuo
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一个基于phg平台的并行有限元生物分子模拟解法器 期刊论文
数值计算与计算机应用, 2016, 卷号: 37, 期号: 1, 页码: 67
作者:  许竞劼;  谢妍;  卢本卓
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Poisson-Nernst-Planck Equations for Simulating Biomolecular Diffusion-Reaction Processes II: Size Effects on Ionic Distributions and Diffusion-Reaction Rates 期刊论文
BIOPHYSICAL JOURNAL, 2011, 卷号: 100, 期号: 10, 页码: 2475-2485
作者:  Lu, Benzhuo;  Zhou, Y. C.
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Poisson-Nernst-Planck equations for simulating biomolecular diffusion-reaction processes I: Finite element solutions 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS, 2010, 卷号: 229, 期号: 19, 页码: 6979-6994
作者:  Lu, Benzhuo;  Holst, Michael J.;  McCammon, J. Andrew;  Zhou, Y. C.
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Electrodiffusion  Poisson-Nernst-Planck equations  Finite element  Singular charges  Molecular surface  Boundary condition  Conditioning