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中国科学院数学与系统科学研究院机构知识库
KMS Of Academy of mathematics and systems sciences, CAS
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研究单元&专题
应用数学研究所 [6]
作者
张世华 [6]
文献类型
期刊论文 [6]
发表日期
2018 [6]
语种
英语 [6]
出处
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发表日期:2018
资助项目:CAS Frontier Science Research Key Project for Top Young Scientist[QYZDB-SSW-SYS008]
资助项目:National Natural Science Foundation of China[61379092]
资助项目:National Natural Science Foundation of China[61422309]
作者:张世华
第一作者
专题:应用数学研究所
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Reveal cell type-specific regulatory elements and their characterized histone code classes via a hidden Markov model
期刊论文
BMC GENOMICS, 2018, 卷号: 19, 页码: 13
作者:
Wang, Can
;
Zhang, Shihua
收藏
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浏览/下载:276/0
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提交时间:2019/01/11
Epigenomics
Cell type-specific regulatory elements
Hidden Markov model
Histone modification
Edge-group sparse PCA for network-guided high dimensional data analysis
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 34, 期号: 20, 页码: 3479-3487
作者:
Min, Wenwen
;
Liu, Juan
;
Zhang, Shihua
收藏
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浏览/下载:209/0
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提交时间:2019/01/11
Matrix Integrative Analysis (MIA) of Multiple Genomic Data for Modular Patterns
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2018, 卷号: 9, 页码: 12
作者:
Chen, Jinyu
;
Zhang, Shihua
收藏
  |  
浏览/下载:207/0
  |  
提交时间:2018/07/30
bioinformatics
multi-dimensional genomics
matrix integrative analysis
data integration
module discovery
non-negative matrix factorization (NMF)
partial least squares (PLS)
Sparse Weighted Canonical Correlation Analysis
期刊论文
CHINESE JOURNAL OF ELECTRONICS, 2018, 卷号: 27, 期号: 3, 页码: 459-466
作者:
Min Wenwen
;
Liu Juan
;
Zhang Shihua
收藏
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浏览/下载:189/0
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提交时间:2018/07/30
Canonical correlation analysis (CCA)
Sparse canonical correlation analysis (SCCA)
Sparse weighted CCA (SWCCA)
Group LASSO regularized SWCCA
Multi-view SWCCA
The Discovery of Mutated Driver Pathways in Cancer: Models and Algorithms
期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 15, 期号: 3, 页码: 988-998
作者:
Zhang, Junhua
;
Zhang, Shihua
收藏
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浏览/下载:238/0
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提交时间:2018/07/30
Bioinformatics
cancer genomics
driver gene
driver pathway
mutual exclusivity
co-occurring mutation
MSIQ: JOINT MODELING OF MULTIPLE RNA-SEQ SAMPLES FOR ACCURATE ISOFORM QUANTIFICATION
期刊论文
ANNALS OF APPLIED STATISTICS, 2018, 卷号: 12, 期号: 1, 页码: 510-539
作者:
Li, Wei Vivian
;
Zhao, Anqi
;
Zhang, Shihua
;
Li, Jingyi Jessica
收藏
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浏览/下载:227/0
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提交时间:2018/07/30
Isoform abundance estimation
joint inference from multiple samples
RNA sequencing
Bayesian hierarchical models
Gibbs sampling
data heterogeneity