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Biomarker interaction selection and disease detection based on multivariate gain ratio 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 16
作者:  Chu, Xiao;  Jiang, Mao;  Liu, Zhuo-Jun
收藏  |  浏览/下载：91/0  |  提交时间：2023/02/07
Multivariate gain ratio  Biomarker interaction  Disease detection  
MUREN: a robust and multi-reference approach of RNA-seq transcript normalization 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2021, 卷号: 22, 期号: 1
作者:  Feng,Yance;  Li,Lei M.
收藏  |  浏览/下载：163/0  |  提交时间：2021/10/26
RNA-seq  Normalization  Asymmetrically regulated transcription profiles (ART)  Skewness  Mode  Multi-reference  
Prediction of enhancer-promoter interactions using the cross-cell type information and domain adversarial neural network 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 16
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：180/0  |  提交时间：2021/01/14
Enhancer–  promoter interactions  Cell line  Convolutional neural network  Transfer learning  Gradient reversal layer  
Prediction of enhancer–promoter interactions using the cross-cell type information and domain adversarial neural network 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2020, 卷号: 21, 期号: 1
作者:  Jing,Fang;  Zhang,Shao-Wu;  Zhang,Shihua
收藏  |  浏览/下载：172/0  |  提交时间：2021/01/14
Enhancer–promoter interactions  Cell line  Convolutional neural network  Transfer learning  Gradient reversal layer  
Transfer posterior error probability estimation for peptide identification 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2020, 卷号: 21, 期号: 1
作者:  Yi,Xinpei;  Gong,Fuzhou;  Fu,Yan
收藏  |  浏览/下载：182/0  |  提交时间：2020/05/24
Proteomics  Mass spectrometry  Quality control  Posterior error probability  Local false discovery rate  Transfer learning  
The cis-trans binding strength defined by motif frequencies facilitates statistical inference of transcriptional regulation 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 11
作者:  Feng, Yance;  Zhang, Sheng;  Li, Liang;  Li, Lei M.
收藏  |  浏览/下载：190/0  |  提交时间：2019/10/28
BASE  Statistical inference  Transcriptional regulation  PUFA  DHA  EPA  Binding strength  
Systems biology intertwines with single cell and AI 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 3
作者:  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：222/0  |  提交时间：2019/10/28
Systems biology  Network  Data integration  
Integrating random walk and binary regression to identify novel miRNA-disease association 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 页码: 13
作者:  Niu, Ya-Wei;  Wang, Guang-Hui;  Yan, Gui-Ying;  Chen, Xing
收藏  |  浏览/下载：224/0  |  提交时间：2019/03/05
microRNA  Disease  miRNA-disease association  Random walk  Binary regression  
RRCRank: a fusion method using rank strategy for residue-residue contact prediction 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2017, 卷号: 18, 期号: 1
作者:  Jing,Xiaoyang;  Dong,Qiwen;  Lu,Ruqian
收藏  |  浏览/下载：153/0  |  提交时间：2018/07/30
Protein residue-residue contact prediction  Learning-to-rank  Fusion method  
Estimating Phred scores of Illumina base calls by logistic regression and sparse modeling 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 18, 页码: 14
作者:  Zhang, Sheng;  Wang, Bo;  Wan, Lin;  Li, Lei M.
收藏  |  浏览/下载：176/0  |  提交时间：2018/07/30
Base-calling  Logistic regression  Quality score  L-1 regularization  AIC  BIC  Empirical discrimination power