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Approximate distance correlation for selecting highly interrelated genes across datasets 期刊论文
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2021, 卷号: 17, 期号: 11, 页码: 18
作者:  Shen, Qunlun;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：129/0  |  提交时间：2022/04/02
Bayesian Joint Matrix Decomposition for Data Integration with Heterogeneous Noise 期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON PATTERN ANALYSIS AND MACHINE INTELLIGENCE, 2021, 卷号: 43, 期号: 4, 页码: 1184-1196
作者:  Zhang, Chihao;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：216/0  |  提交时间：2021/04/26
Matrix decomposition  Bayes methods  Data integration  Inference algorithms  Data models  Data mining  Gaussian distribution  Bayesian methods  matrix decomposition  data integration  variational Bayesian inference  maximum a posterior  
Towards understanding residual and dilated dense neural networks via convolutional sparse coding 期刊论文
NATIONAL SCIENCE REVIEW, 2021, 卷号: 8, 期号: 3, 页码: 13
作者:  Zhang, Zhiyang;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：163/0  |  提交时间：2021/10/26
convolutional neural network  convolutional sparse coding  residual neural network  mixed-scale dense neural network  dilated convolution  dense connection  
A kernel non-negative matrix factorization framework for single cell clustering 期刊论文
APPLIED MATHEMATICAL MODELLING, 2021, 卷号: 90, 页码: 875-888
作者:  Jiang, Hao;  Yi, Ming;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：135/0  |  提交时间：2021/04/26
Single cell RNA-sequencing  Kernel non-negative matrix factorization  Cellular heterogeneity  
Comparison of Computational Methods for Imputing Single-Cell RNA-Sequencing Data 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 17, 期号: 2, 页码: 376-389
作者:  Zhang, Lihua;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：178/0  |  提交时间：2020/05/24
Gene expression  Sequential analysis  Bioinformatics  RNA  Matrix converters  Computational biology  Bayes methods  Single-cell RNA-sequencing technique  dropout event  imputation  algorithm  bioinformatics  
Edge-group sparse PCA for network-guided high dimensional data analysis 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 34, 期号: 20, 页码: 3479-3487
作者:  Min, Wenwen;  Liu, Juan;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：199/0  |  提交时间：2019/01/11
Network-Regularized Sparse Logistic Regression Models for Clinical Risk Prediction and Biomarker Discovery 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 15, 期号: 3, 页码: 944-953
作者:  Min, Wenwen;  Liu, Juan;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：260/0  |  提交时间：2018/07/30
Sparse logistic regression  network-regularized penalty  survival risk prediction  feature selection  
Sparse Weighted Canonical Correlation Analysis 期刊论文
CHINESE JOURNAL OF ELECTRONICS, 2018, 卷号: 27, 期号: 3, 页码: 459-466
作者:  Min Wenwen;  Liu Juan;  Zhang Shihua
收藏  |  浏览/下载：177/0  |  提交时间：2018/07/30
Canonical correlation analysis (CCA)  Sparse canonical correlation analysis (SCCA)  Sparse weighted CCA (SWCCA)  Group LASSO regularized SWCCA  Multi-view SWCCA  
sparseweightedcanonicalcorrelationanalysis 期刊论文
chinesejournalofelectronics, 2018, 卷号: 27, 期号: 3, 页码: 459
作者:  Min Wenwen;  Liu Juan;  Zhang Shihua
收藏  |  浏览/下载：182/0  |  提交时间：2020/01/10
Integrative cancer genomics: models, algorithms and analysis 期刊论文
FRONTIERS OF COMPUTER SCIENCE, 2017, 卷号: 11, 期号: 3, 页码: 392-406
作者:  Chen, Jinyu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：145/0  |  提交时间：2018/07/30
cancer genomics  model  algorithm  data integration  bioinformatics  computational biology