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Interaction-based transcriptome analysis via differential network inference 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 11
作者:  Leng, Jiacheng;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：49/0  |  提交时间：2023/02/07
differential network inference  differential expression analysis  interaction-based transcriptome analysis  
hDirect-MAP: projection-free single-cell modeling of response to checkpoint immunotherapy 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 2, 页码: 16
作者:  Lu, Yong;  Xue, Gang;  Zheng, Ningbo;  Han, Kun;  Yang, Wenzhong;  Wang, Rui-Sheng;  Wu, Lingyun;  Miller, Lance D.;  Pardee, Timothy;  Triozzi, Pierre L.;  Lo, Hui-Wen;  Watabe, Kounosuke;  Wong, Stephen T. C.;  Pasche, Boris C.;  Zhang, Wei;  Jin, Guangxu
收藏  |  浏览/下载：128/0  |  提交时间：2023/02/07
single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)  single-cell mass cytometry (CyTOF)  Pareto optimization  projection-free single-cell modeling  response to immune checkpoint blockade  
Importance-Penalized Joint Graphical Lasso (IPJGL): differential network inference via GGMs 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 3, 页码: 770-777
作者:  Leng, Jiacheng;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：145/0  |  提交时间：2022/04/02
Framework and algorithms for identifying honest blocks in blockchain 期刊论文
PLOS ONE, 2020, 卷号: 15, 期号: 1, 页码: 14
作者:  Wang, Xu;  Gan, Guohua;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：187/0  |  提交时间：2020/06/30
基于\货到人\拣选模式的储位分配问题研究 期刊论文
运筹与管理, 2020, 卷号: 29.0, 期号: 002, 页码: 1-11
作者:  李珍萍;  范欣然;  吴凌云
收藏  |  浏览/下载：163/0  |  提交时间：2021/01/14
货到人  储位分配  整数非线性规划  聚类  贪婪算法  单亲进化遗传算法  
Corbi: a new R package for biological network alignment and querying 期刊论文
BMC Systems Biology, 2013, 卷号: 7, 期号: Suppl 2
作者:  Huang,Qiang;  Wu,Ling-Yun;  Zhang,Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：149/0  |  提交时间：2018/07/30
SANA: an algorithm for sequential and non-sequential protein structure alignment 期刊论文
AMINO ACIDS, 2010, 卷号: 39, 期号: 2, 页码: 417-425
作者:  Wang, Lin;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：156/0  |  提交时间：2018/07/30
Protein structure alignment  Fold comparison  Circular permutation  Functional sites  
Haplotype assembly from aligned weighted SNP fragments 期刊论文
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, 2005, 卷号: 29, 期号: 4, 页码: 281-287
作者:  Zhao, YY;  Wu, LY;  Zhang, JH;  Wang, RS;  Zhang, XS
收藏  |  浏览/下载：102/0  |  提交时间：2018/07/30
SNP  haplotype  assembly  minimum letter flips  dynamic clustering