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EFFICIENT GENERATION OF MEMBRANE AND SOLVENT TETRAHEDRAL MESHES FOR ION CHANNEL FINITE ELEMENT CALCULATION 期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF NUMERICAL ANALYSIS AND MODELING, 2022, 卷号: 19, 期号: 6, 页码: 887-906
作者:  Chao, Zhen;  Gui, Sheng;  Lu, Benzhuo;  Xie, Dexuan
收藏  |  浏览/下载：64/0  |  提交时间：2023/02/07
Finite element method  Poisson-Nernst-Planck equations  ion channel  membrane mesh generation  tetrahedral mesh  
A DECOUPLING TWO-GRID METHOD FOR THE STEADY-STATE POISSON-NERNST-PLANCK EQUATIONS 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL MATHEMATICS, 2019, 卷号: 37, 期号: 4, 页码: 556-578
作者:  Yang, Ying;  Lu, Benzhuo;  Xie, Yan
收藏  |  浏览/下载：160/0  |  提交时间：2020/05/24
Poisson-Nernst-Planck equations  Two-grid finite element method  Decoupling method  Error analysis  Gummel iteration  
ANALYSIS OF THE MEAN FIELD FREE ENERGY FUNCTIONAL OF ELECTROLYTE SOLUTION WITH NONHOMOGENOUS BOUNDARY CONDITIONS AND THE GENERALIZED PB/PNP EQUATIONS WITH INHOMOGENEOUS DIELECTRIC PERMITTIVITY 期刊论文
SIAM JOURNAL ON APPLIED MATHEMATICS, 2018, 卷号: 78, 期号: 2, 页码: 1131-1154
作者:  Liu, Xuejiao;  Qiao, Yu;  Lu, Benzhou
收藏  |  浏览/下载：197/0  |  提交时间：2018/07/30
free energy functional  electrolyte  boundary conditions  variable dielectric  generalized Poisson-Nernst-Planck/Poisson-Boltzmann equations  energy law  
MODIFIED POISSON-NERNST-PLANCK MODEL WITH ACCURATE COULOMB CORRELATION IN VARIABLE MEDIA 期刊论文
SIAM JOURNAL ON APPLIED MATHEMATICS, 2018, 卷号: 78, 期号: 1, 页码: 226-245
作者:  Liu, Pei;  Ji, Xia;  Xu, Zhenli
收藏  |  浏览/下载：208/0  |  提交时间：2018/07/30
charge transport  ion correlation  continuum theory for electrostatics  asymptotic expansion  Green's function  Poisson-Nernst-Planck equations  
A Local Approximation of Fundamental Measure Theory Incorporated into Three Dimensional Poisson-Nernst-Planck Equations to Account for Hard Sphere Repulsion Among Ions 期刊论文
JOURNAL OF STATISTICAL PHYSICS, 2016, 卷号: 163, 期号: 1, 页码: 156-174
作者:  Qiao, Yu;  Liu, Xuejiao;  Chen, Minxin;  Lu, Benzhuo
收藏  |  浏览/下载：170/0  |  提交时间：2018/07/30
Hard sphere repulsion  Three dimensional fundamental measure theory  Poisson-Nernst-Planck equations  Size-modified PNP  Equation of state  
Poisson-Nernst-Planck equations for simulating biomolecular diffusion-reaction processes I: Finite element solutions 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS, 2010, 卷号: 229, 期号: 19, 页码: 6979-6994
作者:  Lu, Benzhuo;  Holst, Michael J.;  McCammon, J. Andrew;  Zhou, Y. C.
收藏  |  浏览/下载：166/0  |  提交时间：2018/07/30
Electrodiffusion  Poisson-Nernst-Planck equations  Finite element  Singular charges  Molecular surface  Boundary condition  Conditioning