KMS Of Academy of mathematics and systems sciences, CAS
一种新的迭代渐进多序列比对算法 | |
张敏1; 方伟武2; 张俊华2![]() | |
2005 | |
发表期刊 | 计算机工程与应用
![]() |
ISSN | 1002-8331 |
卷号 | 041期号:002页码:72 |
摘要 | 该文提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA。该算法先用渐进方法进行多序列比对,然后通过迭代策略.利用上一轮多序列比对结果修正指导树,产生新一轮比对。重复这一过程,直到指导树不再发生变化或满足事先设定的迭代次数为止。以比对数据库BAliBASE中多蛋白质家族lidy为例,对IPMSA算法和ClustalW算法进行的比较研究表明,该算法能更有效地比对分歧较大的序列,并改进其系统发育树。 |
语种 | 英语 |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://ir.amss.ac.cn/handle/2S8OKBNM/41786 |
专题 | 应用数学研究所 |
作者单位 | 1.大连理工大学 2.中国科学院数学与系统科学研究院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 张敏,方伟武,张俊华,等. 一种新的迭代渐进多序列比对算法[J]. 计算机工程与应用,2005,041(002):72. |
APA | 张敏,方伟武,张俊华,&迟忠先.(2005).一种新的迭代渐进多序列比对算法.计算机工程与应用,041(002),72. |
MLA | 张敏,et al."一种新的迭代渐进多序列比对算法".计算机工程与应用 041.002(2005):72. |
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