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一种新的迭代渐进多序列比对算法
张敏1; 方伟武2; 张俊华2; 迟忠先1
2005
发表期刊计算机工程与应用
ISSN1002-8331
卷号041期号:002页码:72
摘要该文提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA。该算法先用渐进方法进行多序列比对,然后通过迭代策略.利用上一轮多序列比对结果修正指导树,产生新一轮比对。重复这一过程,直到指导树不再发生变化或满足事先设定的迭代次数为止。以比对数据库BAliBASE中多蛋白质家族lidy为例,对IPMSA算法和ClustalW算法进行的比较研究表明,该算法能更有效地比对分歧较大的序列,并改进其系统发育树。
语种英语
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.amss.ac.cn/handle/2S8OKBNM/41786
专题应用数学研究所
作者单位1.大连理工大学
2.中国科学院数学与系统科学研究院
推荐引用方式
GB/T 7714
张敏,方伟武,张俊华,等. 一种新的迭代渐进多序列比对算法[J]. 计算机工程与应用,2005,041(002):72.
APA 张敏,方伟武,张俊华,&迟忠先.(2005).一种新的迭代渐进多序列比对算法.计算机工程与应用,041(002),72.
MLA 张敏,et al."一种新的迭代渐进多序列比对算法".计算机工程与应用 041.002(2005):72.
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