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Poisson-Nernst-Planck equations for simulating biomolecular diffusion-reaction processes I: Finite element solutions 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS, 2010, 卷号: 229, 期号: 19, 页码: 6979-6994
作者:  Lu, Benzhuo;  Holst, Michael J.;  McCammon, J. Andrew;  Zhou, Y. C.
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Electrodiffusion  Poisson-Nernst-Planck equations  Finite element  Singular charges  Molecular surface  Boundary condition  Conditioning  
AFMPB: An adaptive fast multipole, Poisson-Boltzmann solver for calculating electrostatics in biomolecular systems 期刊论文
COMPUTER PHYSICS COMMUNICATIONS, 2010, 卷号: 181, 期号: 6, 页码: 1150-1160
作者:  Lu, Benzhuo;  Cheng, Xiaolin;  Huang, Jingfang;  McCammon, J. Andrew
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Poisson-Boltzmann equation  Boundary integral equation  Node-patch method  Krylov subspace methods  Fast multipole methods  Diagonal translations  
Two-scale finite element Green's function approximations with applications to electrostatic potential computation 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2010, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 177-193
作者:  Yang, Ying;  Zhou, Aihui
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Error analysis  finite element  Green's function  Poisson-Boltzmann equation  two-scale