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A stabilized finite element method for the Poisson-Nernst-Planck equations in three-dimensional ion channel simulations 期刊论文
APPLIED MATHEMATICS LETTERS, 2021, 卷号: 111, 页码: 9
作者:  Wang, Qin;  Li, Hongliang;  Zhang, Linbo;  Lu, Benzhuo
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Poisson-Nernst-Planck  Stabilized finite element method  SUPG  interior penalty  
Iterative two-grid methods for semilinear elliptic equations 期刊论文
COMPUTERS & MATHEMATICS WITH APPLICATIONS, 2020, 卷号: 80, 期号: 3, 页码: 522-530
作者:  Zhang, Weifeng;  Fan, Ronghong;  Zhong, Liuqiang
收藏  |  浏览/下载：175/0  |  提交时间：2020/06/30
Iterative methods  Two-grid method  Convergence  Semilinear elliptic equations  
THE QUADRATIC SPECHT TRIANGLE 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL MATHEMATICS, 2020, 卷号: 38, 期号: 1, 页码: 103-124
作者:  Li, Hongliang;  Ming, Pingbing;  Shi, Zhongci
收藏  |  浏览/下载：187/0  |  提交时间：2020/05/24
Specht triangle  Plate bending element  Basis functions  
DASHMM Accelerated Adaptive Fast Multipole Poisson-Boltzmann Solver on Distributed Memory Architecture 期刊论文
COMMUNICATIONS IN COMPUTATIONAL PHYSICS, 2019, 卷号: 25, 期号: 4, 页码: 1235-1258
作者:  Zhang, Bo;  DeBuhr, Jackson;  Niedzielski, Drake;  Mayolo, Silvio;  Lu, Benzhuo;  Sterling, Thomas
收藏  |  浏览/下载：221/0  |  提交时间：2019/03/05
Poisson-Boltzmann equation  boundary element method  DASHMM  distributed computing  
A DECOUPLING TWO-GRID METHOD FOR THE STEADY-STATE POISSON-NERNST-PLANCK EQUATIONS 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL MATHEMATICS, 2019, 卷号: 37, 期号: 4, 页码: 556-578
作者:  Yang, Ying;  Lu, Benzhuo;  Xie, Yan
收藏  |  浏览/下载：162/0  |  提交时间：2020/05/24
Poisson-Nernst-Planck equations  Two-grid finite element method  Decoupling method  Error analysis  Gummel iteration  
A Finite Element Solution of Lateral Periodic Poisson-Boltzmann Model for Membrane Channel Proteins 期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2018, 卷号: 19, 期号: 3, 页码: 17
作者:  Ji, Nan;  Liu, Tiantian;  Xu, Jingjie;  Shen, Longzhu Q.;  Lu, Benzhuo
收藏  |  浏览/下载：202/0  |  提交时间：2018/07/30
laterally periodic Poisson-Boltzmann model  finite element method  membrane channel proteins  pore region  solvation  
EFFICIENT AND QUALIFIED MESH GENERATION FOR GAUSSIAN MOLECULAR SURFACE USING ADAPTIVE PARTITION AND PIECEWISE POLYNOMIAL APPROXIMATION 期刊论文
SIAM JOURNAL ON SCIENTIFIC COMPUTING, 2018, 卷号: 40, 期号: 2, 页码: B507-B527
作者:  Liu, Tiantian;  Chen, Minxin;  Lu, Benzhuo
收藏  |  浏览/下载：194/0  |  提交时间：2018/07/30
surface mesh generation  Gaussian surface  triangulation  adaptive partition  trilinear polynomial  
Incorporating Born solvation energy into the three-dimensional Poisson-Nernst-Planck model to study ion selectivity in KcsA K+ channels 期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2017, 卷号: 96, 期号: 6, 页码: 10
作者:  Liu, Xuejiao;  Lu, Benzhuo
收藏  |  浏览/下载：190/0  |  提交时间：2018/07/30
Two robust nonconforming -elements for linear strain gradient elasticity 期刊论文
NUMERISCHE MATHEMATIK, 2017, 卷号: 137, 期号: 3, 页码: 691-711
作者:  Li, Hongliang;  Ming, Pingbing;  Shi, Zhong-ci
收藏  |  浏览/下载：155/0  |  提交时间：2018/07/30
Analysis of Geometrically Consistent Schemes with Finite Range Interaction 期刊论文
COMMUNICATIONS IN COMPUTATIONAL PHYSICS, 2017, 卷号: 22, 期号: 5, 页码: 1333-1361
作者:  Li, Hongliang;  Ming, Pingbing
收藏  |  浏览/下载：175/0  |  提交时间：2018/07/30
Quasicontinuum method  atomic-to-continuum coupling  stability  finite range interactions