相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究

CSpace

	相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究
	赵辉 1; 李启寨 2; 李俊 3; 曾长青 4; 胡松年 5; 于军 6
	2006
发表期刊	中国科学C辑:生命科学
ISSN	1006-9259
页码	1-8
摘要	碱基替换突变是形成物种多态性和造成生物进化的根本原因之一.近年的研究表明:基因组的碱基组分在不同程度上与碱基替换突变的发生相关.以水稻全基因组3611007个SNPs(包括45462个编码区SNPs和242811个内含子区SNPs)和拟南芥全基因组32019个SNPs为研究对象,研究突变位点周围的碱基A&T(A和T)的使用频率和点突变类型的相关性,结果表明:水稻和拟南芥全基因组上转换和颠换的比值(Ts/Tv)以及紧邻突变位点(上下游各1个碱基)上A&T碱基的个数负相关.统计了6种SNP的AT2(直接相邻的碱基是A或T的个数)和AT0(直接相邻碱基是C或G的个数),发现水稻和拟南芥都是C/G型SNP的AT2/AT0值最大,说明C/G型SNP可能受直接临近区域上A&T碱基的影响最大.在水稻全基因组SNPs中,A&T碱基影响突变的范围局限在突变位点上下游2个碱基内.拟南芥A&T碱基影响其全基因组SNPs的范围不超过上下游4个碱基.
关键词	点突变单碱基多态性替换替换偏差转换颠换
收录类别	CSCD
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:2710017
引用统计
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.amss.ac.cn/handle/2S8OKBNM/56902
专题	中国科学院数学与系统科学研究院
作者单位	1.黑龙江大学 2.中国科学院数学与系统科学研究院 3.安徽医科大学 4.福建省省立医院 5.中国科学院北京基因组研究所 6.华中科技大学
推荐引用方式 GB/T 7714	赵辉,李启寨,李俊,等. 相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究[J]. 中国科学C辑:生命科学,2006:1-8.
APA	赵辉,李启寨,李俊,曾长青,胡松年,&于军.(2006).相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究.中国科学C辑:生命科学,1-8.
MLA	赵辉,et al."相邻碱基组分与产生SNP的转换或颠换在植物基因组中的研究".中国科学C辑:生命科学 (2006):1-8.