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Disease category-specific annotation of variants using an ensemble learning framework 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 15
作者:  Cao, Zhen;  Huang, Yanting;  Duan, Ran;  Jin, Peng;  Qin, Zhaohui S.;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：110/0  |  提交时间：2022/06/21
complex disease  disease category  functional annotation  non-coding variant  ensemble learning  
An Integrative Framework for Combining Sequence and Epigenomic Data to Predict Transcription Factor Binding Sites Using Deep Learning 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 18, 期号: 1, 页码: 355-364
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Cao, Zhen;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：160/0  |  提交时间：2021/04/26
Bioinformatics  machine learning  transcription factors binding sites  convolutional neural networks  DNA accessibility  histone modification  
Probe Efficient Feature Representation of Gapped K-mer Frequency Vectors from Sequences Using Deep Neural Networks 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 17, 期号: 2, 页码: 657-667
作者:  Cao, Zhen;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：180/0  |  提交时间：2020/05/24
DNA  Bioinformatics  Kernel  Feature extraction  Support vector machines  Genomics  Task analysis  Bioinformatics  machine learning  gapped k-mer  deep neural network  transcription factor binding site prediction  
Simple tricks of convolutional neural network architectures improve DNA-protein binding prediction 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 11, 页码: 1837-1843
作者:  Cao, Zhen;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：188/0  |  提交时间：2020/01/10
Reasoning and querying web-scale open data based on DL-Lite(A) in a divide-and-conquer way 期刊论文
JOURNAL OF WEB SEMANTICS, 2019, 卷号: 55, 页码: 122-144
作者:  Gu, Zhenzhen;  Zhang, Songmao;  Cao, Cungen
收藏  |  浏览/下载：151/0  |  提交时间：2020/01/10
DL-lite(A)  Open data  Semantic web  Knowledge base  Query answering  Divide-and-conquer  
Omics tools for the needle out of haystack? 期刊论文
JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS, 2018, 卷号: 45, 期号: 7, 页码: 343-344
作者:  Cao, Zhiwei;  Wang, Xiu-Jie;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：173/0  |  提交时间：2018/10/07
Assessing integrated water use and wastewater treatment systems in China: A mixed network structure two-stage SBM DEA model 期刊论文
JOURNAL OF CLEANER PRODUCTION, 2018, 卷号: 185, 页码: 533-546
作者:  Zhou, Xiaoyang;  Luo, Rui;  Yao, Liming;  Cao, Shan;  Wang, Shouyang;  Lev, Benjamin
收藏  |  浏览/下载：186/0  |  提交时间：2018/07/30
Water resource  Overall efficiency  Mixed network structure  Two-stage SBM DEA  Undesirable output  
Complex Dynamics Induced by Nonlinear Pollution Absorption, Pollution Emission Rate and Effectiveness of Abatement Technology in an OLG Model 期刊论文
SUSTAINABILITY, 2017, 卷号: 9, 期号: 5, 页码: 11
作者:  Cao, Dong;  Wang, Lin;  Wang, Shouyang
收藏  |  浏览/下载：109/0  |  提交时间：2018/07/30
pollution absorption  pollution emission  abatement technology  OLG model  
基于GMDH混合模型的能源消费量预测研究 期刊论文
中国管理科学, 2017, 卷号: 000, 期号: 012, 页码: 158
作者:  肖进;  孙海燕;  刘敦虎;  曹瀚文;  汪寿阳
收藏  |  浏览/下载：131/0  |  提交时间：2020/01/10
An integrative and comparative study of pan-cancer transcriptomes reveals distinct cancer common and specific signatures 期刊论文
SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 卷号: 6, 页码: 13
作者:  Cao, Zhen;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：130/0  |  提交时间：2018/07/30