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Poisson-Nernst-Planck Equations for Simulating Biomolecular Diffusion-Reaction Processes II: Size Effects on Ionic Distributions and Diffusion-Reaction Rates 期刊论文
BIOPHYSICAL JOURNAL, 2011, 卷号: 100, 期号: 10, 页码: 2475-2485
作者:  Lu, Benzhuo;  Zhou, Y. C.
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Testing a Hybrid Solvation Model with a Transition Layer Via Molecular Dynamics Simulation 期刊论文
BIOPHYSICAL JOURNAL, 2010, 卷号: 98, 期号: 3, 页码: 575A-575A
作者:  Song, Wei;  Qin, Peihua;  Lin, Yuchun;  Baumketner, Andriy;  Cai, Wei;  Jacobs, Donald
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Enzymatic Activity versus Structural Dynamics: The Case of Acetylcholinesterase Tetramer 期刊论文
BIOPHYSICAL JOURNAL, 2009, 卷号: 97, 期号: 3, 页码: 897-905
作者:  Gorfe, Alemayehu A.;  Lu, Benzhuo;  Yu, Zeyun;  McCammon, J. Andrew
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Optimal HP configurations of proteins by combining local search with elastic net algorithm 期刊论文
JOURNAL OF BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL METHODS, 2007, 卷号: 70, 期号: 3, 页码: 335-340
作者:  Guo, Yu-Zhen;  Feng, En-Min;  Wang, Yong
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protein folding problem  2D HP lattice model  elastic net algorithm  local search method  
Monte Carlo implementation of supercoiled double-stranded DNA 期刊论文
BIOPHYSICAL JOURNAL, 2000, 卷号: 78, 期号: 4, 页码: 1979-1987
作者:  Zhang, Y;  Zhou, HJ;  Ou-Yang, ZC
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