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hDirect-MAP: projection-free single-cell modeling of response to checkpoint immunotherapy 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 2, 页码: 16
作者:  Lu, Yong;  Xue, Gang;  Zheng, Ningbo;  Han, Kun;  Yang, Wenzhong;  Wang, Rui-Sheng;  Wu, Lingyun;  Miller, Lance D.;  Pardee, Timothy;  Triozzi, Pierre L.;  Lo, Hui-Wen;  Watabe, Kounosuke;  Wong, Stephen T. C.;  Pasche, Boris C.;  Zhang, Wei;  Jin, Guangxu
收藏  |  浏览/下载：118/0  |  提交时间：2023/02/07
single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)  single-cell mass cytometry (CyTOF)  Pareto optimization  projection-free single-cell modeling  response to immune checkpoint blockade  
gomafunctionalenrichmentanalysistoolbasedongomodules 期刊论文
chinesejournalofcancer, 2013, 卷号: 32, 期号: 4, 页码: 195
作者:  Huang Qiang;  Wu Lingyun;  Wang Yong;  Zhang Xiangsun
收藏  |  浏览/下载：169/0  |  提交时间：2020/01/10
NOA: a novel Network Ontology Analysis method 期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2011, 卷号: 39, 期号: 13, 页码: 12
作者:  Wang, Jiguang;  Huang, Qiang;  Liu, Zhi-Ping;  Wang, Yong;  Wu, Ling-Yun;  Chen, Luonan;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：154/0  |  提交时间：2018/07/30
SANA: an algorithm for sequential and non-sequential protein structure alignment 期刊论文
AMINO ACIDS, 2010, 卷号: 39, 期号: 2, 页码: 417-425
作者:  Wang, Lin;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：153/0  |  提交时间：2018/07/30
Protein structure alignment  Fold comparison  Circular permutation  Functional sites  
Prediction of protein-RNA binding sites by a random forest method with combined features 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2010, 卷号: 26, 期号: 13, 页码: 1616-1622
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：142/0  |  提交时间：2018/07/30
多阶段多目标多部门应急决策模型 期刊论文
系统工程理论与实践, 2010, 卷号: 000, 期号: 011, 页码: 1977
作者:  陈兴;  王勇;  吴凌云;  闫桂英;  朱伟
收藏  |  浏览/下载：152/0  |  提交时间：2020/01/10
Prediction of palmitoylation sites using the composition of k-spaced amino acid pairs 期刊论文
PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION, 2009, 卷号: 22, 期号: 11, 页码: 707-712
作者:  Wang, Xiao-Bo;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong-Cui;  Deng, Nai-Yang
收藏  |  浏览/下载：111/0  |  提交时间：2018/07/30
CKSAAP-Palm  palmitoylated proteins  palmitoylation  support vector machine  
Evaluating Protein Similarity from Coarse Structures 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2009, 卷号: 6, 期号: 4, 页码: 583-593
作者:  Wang, Yong;  Wu, Ling-Yun;  Zhang, Ji-Hong;  Zhan, Zhong-Wei;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：149/0  |  提交时间：2018/07/30
Protein structure  structure comparison  protein surface  
Predicting DNA- and RNA-binding proteins from sequences with kernel methods 期刊论文
JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, 2009, 卷号: 258, 期号: 2, 页码: 289-293
作者:  Shao, Xiaojian;  Tian, Yingjie;  Wu, Lingyun;  Wang, Yong;  Jing, Ling;  Deng, Naiyang
收藏  |  浏览/下载：139/0  |  提交时间：2018/07/30
Bioinformatics  Protein function  Conjoint triad  Nucleic-acid-binding protein  Support vector machine  
Bridging protein local structures and protein functions 期刊论文
AMINO ACIDS, 2008, 卷号: 35, 期号: 3, 页码: 627-650
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：131/0  |  提交时间：2018/07/30
functional genomics  functional motifs  local structures  protein function prediction