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Infer Metagenomic Abundance and Reveal Homologous Genomes Based on the Structure of Taxonomy Tree 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2015, 卷号: 12, 期号: 5, 页码: 1112-1122
作者:  Qiu, Yu-Qing;  Tian, Xue;  Zhang, Shihua
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Metagenomics  abundance estimation  taxonomy tree  expectation-maximization algorithm  
Guest Editorial for Special Section on ISB/TBC 2014 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2015, 卷号: 12, 期号: 5, 页码: 1074-1075
作者:  Zhang, Shihua;  Chen, Luonan
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Systematic DNA methylation analysis of multiple cell lines reveals common and specific patterns within and across tissues of origin 期刊论文
HUMAN MOLECULAR GENETICS, 2015, 卷号: 24, 期号: 15, 页码: 4374-4384
作者:  Yang, Xiaofei;  Shao, Xiaojian;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
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Tumor characterization and stratification by integrated molecular profiles reveals essential pan-cancer features 期刊论文
BMC GENOMICS, 2015, 卷号: 16, 页码: 12
作者:  Liu, Zhaoqi;  Zhang, Shihua
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IIIDB: a database for isoform-isoform interactions and isoform network modules 期刊论文
BMC Genomics, 2015, 卷号: 16, 期号: Suppl 2
作者:  Tseng,Yu-Ting;  Li,Wenyuan;  Chen,Ching-Hsien;  Zhang,Shihua;  Chen,Jeremy JW;  Zhou,Xianghong Jasmine;  Liu,Chun-Chi
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Over-expression of EPS15 is a favorable prognostic factor in breast cancer 期刊论文
MOLECULAR BIOSYSTEMS, 2015, 卷号: 11, 期号: 11, 页码: 2978-2985
作者:  Dai, Xiaofeng;  Liu, Zhaoqi;  Zhang, Shihua
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