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Interaction-based transcriptome analysis via differential network inference 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 11
作者:  Leng, Jiacheng;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：46/0  |  提交时间：2023/02/07
differential network inference  differential expression analysis  interaction-based transcriptome analysis  
hDirect-MAP: projection-free single-cell modeling of response to checkpoint immunotherapy 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 2, 页码: 16
作者:  Lu, Yong;  Xue, Gang;  Zheng, Ningbo;  Han, Kun;  Yang, Wenzhong;  Wang, Rui-Sheng;  Wu, Lingyun;  Miller, Lance D.;  Pardee, Timothy;  Triozzi, Pierre L.;  Lo, Hui-Wen;  Watabe, Kounosuke;  Wong, Stephen T. C.;  Pasche, Boris C.;  Zhang, Wei;  Jin, Guangxu
收藏  |  浏览/下载：119/0  |  提交时间：2023/02/07
single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)  single-cell mass cytometry (CyTOF)  Pareto optimization  projection-free single-cell modeling  response to immune checkpoint blockade  
Importance-Penalized Joint Graphical Lasso (IPJGL): differential network inference via GGMs 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 38, 期号: 3, 页码: 770-777
作者:  Leng, Jiacheng;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：141/0  |  提交时间：2022/04/02
Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data 期刊论文
NATURE BIOTECHNOLOGY, 2021, 页码: 18
作者:  Sun, Duanchen;  Guan, Xiangnan;  Moran, Amy E.;  Wu, Ling-Yun;  Qian, David Z.;  Schedin, Pepper;  Dai, Mu-Shui;  Danilov, Alexey, V;  Alumkal, Joshi J.;  Adey, Andrew C.;  Spellman, Paul T.;  Xia, Zheng
收藏  |  浏览/下载：138/0  |  提交时间：2022/04/02
Identification of Common Driver Gene Modules and Associations between Cancers through Integrated Network Analysis 期刊论文
GLOBAL CHALLENGES, 2021, 页码: 13
作者:  Gao, Bo;  Zhao, Yue;  Gao, Yonghang;  Li, Guojun;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：178/0  |  提交时间：2021/10/26
driver gene module  gene mutation  mutual exclusivity  network analysis  signaling pathway  
Framework and algorithms for identifying honest blocks in blockchain 期刊论文
PLOS ONE, 2020, 卷号: 15, 期号: 1, 页码: 14
作者:  Wang, Xu;  Gan, Guohua;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：184/0  |  提交时间：2020/06/30
区块链性能的量化分析研究 期刊论文
计算机工程与应用, 2020, 卷号: 56, 期号: 3, 页码: 55-60
作者:  王旭;  甘国华;  吴凌云
收藏  |  浏览/下载：210/0  |  提交时间：2020/06/30
Blockchain  performance  security  Transactions Per Second(TPS)  区块链  性能  安全性  每秒交易处理量  
基于AGV的智能仓库系统订单分批问题研究 期刊论文
运筹与管理, 2020, 卷号: 29, 期号: 9, 页码: 1-9
作者:  李珍萍;  付红叶;  卜晓奇;  张国维;  吴凌云
收藏  |  浏览/下载：148/0  |  提交时间：2021/01/14
intelligent warehouse  AGV  order batching  integer programming model  weighted similarity  greedy algorithm  智能仓库  AGV  订单分批  整数规划模型  加权相似度  贪婪算法  
基于\货到人\拣选模式的储位分配问题研究 期刊论文
运筹与管理, 2020, 卷号: 29.0, 期号: 002, 页码: 1-11
作者:  李珍萍;  范欣然;  吴凌云
收藏  |  浏览/下载：158/0  |  提交时间：2021/01/14
货到人  储位分配  整数非线性规划  聚类  贪婪算法  单亲进化遗传算法  
Discovering cooperative biomarkers for heterogeneous complex disease diagnoses 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 89-101
作者:  Sun, Duanchen;  Ren, Xianwen;  Ari, Eszter;  Korcsmaros, Tamas;  Csermely, Peter;  Wu, Ling-Yun
收藏  |  浏览/下载：285/0  |  提交时间：2019/03/05
heterogeneous diseases  cancer biomarker  network-based  cooperative biomarker  gene expression