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Circular Trajectory Reconstruction Uncovers Cell-Cycle Progression and Regulatory Dynamics from Single-Cell Hi-C Maps 期刊论文
ADVANCED SCIENCE, 2019, 页码: 13
作者:  Ye, Yusen;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
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cell cycle  chromosomal architectures  circular trajectory  dynamic structures  single-cell Hi-C maps  
MSTD: an efficient method for detecting multi-scale topological domains from symmetric and asymmetric 3D genomic maps 期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2019, 卷号: 47, 期号: 11, 页码: 11
作者:  Ye, Yusen;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：158/0  |  提交时间：2020/01/10
Integrative Analysis of Transcription Factor Combinatorial Interactions Using a Bayesian Tensor Factorization Approach 期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2017, 卷号: 8, 页码: 12
作者:  Ye, Yusen;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：146/0  |  提交时间：2018/07/30
transcription regulation  TF regulatory networks  tensor factorization  integrative analysis of omics data  biological networks