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Prediction of the transcription factor binding sites with meta-learning 期刊论文
METHODS, 2022, 卷号: 203, 页码: 207-213
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：170/0  |  提交时间：2023/02/07
Convolution neural network  Transcription factor binding sites  Meta learning  Noisy labels data  
An Integrative Framework for Combining Sequence and Epigenomic Data to Predict Transcription Factor Binding Sites Using Deep Learning 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 18, 期号: 1, 页码: 355-364
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Cao, Zhen;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：167/0  |  提交时间：2021/04/26
Bioinformatics  machine learning  transcription factors binding sites  convolutional neural networks  DNA accessibility  histone modification  
On uniqueness of static asymptotically anti-de Sitter black hole 期刊论文
Classical and Quantum Gravity, 2020, 卷号: 37, 期号: 24
作者:  He,Xiaokai;  Cao,Zhoujian;  Fang,Xiongjun;  Jing,Jiliang;  Wu,Xiaoning
收藏  |  浏览/下载：181/0  |  提交时间：2021/01/14
multipole moments of space-time  uniqueness theorem of black hole  asymptotic AdS spacetime  
Prediction of enhancer-promoter interactions using the cross-cell type information and domain adversarial neural network 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 16
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：140/0  |  提交时间：2021/01/14
Enhancer–  promoter interactions  Cell line  Convolutional neural network  Transfer learning  Gradient reversal layer  
Prediction of enhancer–promoter interactions using the cross-cell type information and domain adversarial neural network 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2020, 卷号: 21, 期号: 1
作者:  Jing,Fang;  Zhang,Shao-Wu;  Zhang,Shihua
收藏  |  浏览/下载：142/0  |  提交时间：2021/01/14
Enhancer–promoter interactions  Cell line  Convolutional neural network  Transfer learning  Gradient reversal layer  
Brief Survey of Biological Network Alignment and a Variant with Incorporation of Functional Annotations 期刊论文
CURRENT BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 4-10
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：182/0  |  提交时间：2019/04/02
Biological network  network alignment  gene ontology  alignment graph  optimization  
流态化非均匀结构的概率模型 期刊论文
应用数学学报, 2000, 卷号: 023, 期号: 002, 页码: 280
作者:  李静海;  马志明;  陈敏;  方碧琪;  崔和平;  吴国富
收藏  |  浏览/下载：143/0  |  提交时间：2020/01/10