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Structure alignment-based classification of RNA-binding pockets reveals regional RNA recognition motifs on protein surfaces 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 18, 页码: 13
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Liu, Shutang;  Chen, Ruitang;  Huang, Xiaopeng;  Wu, Ling-Yun
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RNA-binding pocket  Local structure classification  Structural alignment  Network clustering  Structure motif  
NOA: a novel Network Ontology Analysis method 期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2011, 卷号: 39, 期号: 13, 页码: 12
作者:  Wang, Jiguang;  Huang, Qiang;  Liu, Zhi-Ping;  Wang, Yong;  Wu, Ling-Yun;  Chen, Luonan;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：154/0  |  提交时间：2018/07/30
SANA: an algorithm for sequential and non-sequential protein structure alignment 期刊论文
AMINO ACIDS, 2010, 卷号: 39, 期号: 2, 页码: 417-425
作者:  Wang, Lin;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：153/0  |  提交时间：2018/07/30
Protein structure alignment  Fold comparison  Circular permutation  Functional sites  
Prediction of protein-RNA binding sites by a random forest method with combined features 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2010, 卷号: 26, 期号: 13, 页码: 1616-1622
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：142/0  |  提交时间：2018/07/30
多阶段多目标多部门应急决策模型 期刊论文
系统工程理论与实践, 2010, 卷号: 000, 期号: 011, 页码: 1977
作者:  陈兴;  王勇;  吴凌云;  闫桂英;  朱伟
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Evaluating Protein Similarity from Coarse Structures 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2009, 卷号: 6, 期号: 4, 页码: 583-593
作者:  Wang, Yong;  Wu, Ling-Yun;  Zhang, Ji-Hong;  Zhan, Zhong-Wei;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：149/0  |  提交时间：2018/07/30
Protein structure  structure comparison  protein surface  
Self-organizing map approaches for the haplotype assembly problem 期刊论文
MATHEMATICS AND COMPUTERS IN SIMULATION, 2009, 卷号: 79, 期号: 10, 页码: 3026-3037
作者:  Wu, Ling-Yun;  Li, Zhenping;  Wang, Rui-Sheng;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：138/0  |  提交时间：2018/07/30
SNP  Haplotype assembly  Minimum error correction  Self-organizing maps  Neural network  
Bridging protein local structures and protein functions 期刊论文
AMINO ACIDS, 2008, 卷号: 35, 期号: 3, 页码: 627-650
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：131/0  |  提交时间：2018/07/30
functional genomics  functional motifs  local structures  protein function prediction  
A fast haplotype inference method for large population genotype data 期刊论文
COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, 2008, 卷号: 52, 期号: 11, 页码: 4891-4902
作者:  Zhang, Ji-Hong;  Wu, Ling-Yun;  Chen, Jian;  Zhang, Xiang-Sun
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Analysis of protein surface patterns by pocket similarity network 期刊论文
PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, 2008, 卷号: 15, 期号: 5, 页码: 448-455
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：157/0  |  提交时间：2018/07/30
protein surface pattern  pocket similarity  complex network  functional genomics  systems biology