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Joint reconstruction of cis-regulatory interaction networks across multiple tissues using single-cell chromatin accessibility data 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 22, 期号: 3, 页码: 15
作者:  Dong, Kangning;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：115/0  |  提交时间：2022/04/02
cis-regulatory interaction networks  single-cell ATAC-seq  Gaussian graphical LASSO  
Large-scale determination and characterization of cell type-specific regulatory elements in the human genome 期刊论文
Journal of Molecular Cell Biology, 2017, 卷号: 9, 期号: 6, 页码: 463
作者:  Wang Can;  Zhang Shihua
收藏  |  浏览/下载：143/0  |  提交时间：2018/07/30
Comparative DNA methylation analysis to decipher common and cell type-specific patterns among multiple cell types 期刊论文
BRIEFINGS IN FUNCTIONAL GENOMICS, 2016, 卷号: 15, 期号: 6, 页码: 399-407
作者:  Yang, Xiaofei;  Shao, Xiaojian;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：166/0  |  提交时间：2018/07/30
DNA methylation patterns  differentially methylation regions  comparative studies  tissue-specific methylation  cancer epigenomics