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Annotating regulatory elements by heterogeneous network embedding 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 13
作者:  Lu, Yurun;  Feng, Zhanying;  Zhang, Songmao;  Wang, Yong
收藏  |  浏览/下载：136/0  |  提交时间：2022/06/21
Associating lncRNAs with small molecules via bilevel optimization reveals cancer-related lncRNAs 期刊论文
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2019, 卷号: 15, 期号: 12, 页码: 20
作者:  Wang, Yongcui;  Chen, Shilong;  Chen, Luonan;  Wang, Yong
收藏  |  浏览/下载：181/0  |  提交时间：2020/05/24
Integrative analysis of single-cell genomics data by coupled nonnegative matrix factorizations 期刊论文
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2018, 卷号: 115, 期号: 30, 页码: 7723-7728
作者:  Duren, Zhana;  Chen, Xi;  Zamanighomi, Mahdi;  Zeng, Wanwen;  Satpathy, Ansuman T.;  Chang, Howard Y.;  Wang, Yong;  Wong, Wing Hung
收藏  |  浏览/下载：177/0  |  提交时间：2019/12/13
coupled clustering  NMF  single-cell genomic data  
Gene co-opening network deciphers gene functional relationships 期刊论文
MOLECULAR BIOSYSTEMS, 2017, 卷号: 13, 期号: 11, 页码: 2428-2439
作者:  Li, Wenran;  Wang, Meng;  Sun, Jinghao;  Wang, Yong;  Jiang, Rui
收藏  |  浏览/下载：142/0  |  提交时间：2018/07/30
Kernel-based data fusion improves the drug-protein interaction prediction 期刊论文
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, 2011, 卷号: 35, 期号: 6, 页码: 353-362
作者:  Wang, Yong-Cui;  Zhang, Chun-Hua;  Deng, Nai-Yang;  Wang, Yong
收藏  |  浏览/下载：140/0  |  提交时间：2018/07/30
Drug-target interaction  Chemical space  Pharmacological space  Therapeutic space  Genomic space  Kernel function  Support vector machine  
Computationally Probing Drug-Protein Interactions Via Support Vector Machine 期刊论文
LETTERS IN DRUG DESIGN & DISCOVERY, 2010, 卷号: 7, 期号: 5, 页码: 370-378
作者:  Wang, Yong-Cui;  Yang, Zhi-Xia;  Wang, Yong;  Deng, Nai-Yang
收藏  |  浏览/下载：115/0  |  提交时间：2018/07/30
Drug-target interaction  Chemical structure  Protein sequence  Imbalance problem  Support vector machine  
Reverse engineering large-scale genetic networks: synthetic versus real data 期刊论文
JOURNAL OF GENETICS, 2010, 卷号: 89, 期号: 1, 页码: 73-80
作者:  Zhang, Luwen;  Xiao, Mei;  Wang, Yong;  Zhang, Wu
收藏  |  浏览/下载：98/0  |  提交时间：2018/07/30
gene regulatory network  single gene perturbation  linear model  stepwise  simulated network  
A Network Biology Study on Circadian Rhythm by Integrating Various Omics Data 期刊论文
OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY, 2009, 卷号: 13, 期号: 4, 页码: 313-324
作者:  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：123/0  |  提交时间：2018/07/30
Analysis on multi-domain cooperation for predicting protein-protein interactions 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2007, 卷号: 8, 页码: 20
作者:  Wang, Rui-Sheng;  Wang, Yong;  Wu, Ling-Yun;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：138/0  |  提交时间：2018/07/30