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Conic shapes have higher sensitivity than cylindrical ones in nanopore DNA sequencing 期刊论文
SCIENTIFIC REPORTS, 2018, 卷号: 8, 页码: 11
作者:  Tu, Bin;  Bai, Shiyang;  Lu, Benzhuo;  Fang, Qiaojun
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Automated Parallel and Body-Fitted Mesh Generation in Finite Element Simulation of Macromolecular Systems 期刊论文
COMMUNICATIONS IN COMPUTATIONAL PHYSICS, 2016, 卷号: 19, 期号: 3, 页码: 582-602
作者:  Xie, Yan;  Liu, Tiantian;  Tu, Bin;  Lu, Benzhuo;  Zhang, Linbo
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Parallel mesh generation  body-fitted  PHG  biomolecules  finite element simulation  
TMSmesh: A Robust Method for Molecular Surface Mesh Generation Using a Trace Technique 期刊论文
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, 2011, 卷号: 7, 期号: 1, 页码: 203-212
作者:  Chen, Minxin;  Lu, Benzhuo
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Poisson-Nernst-Planck equations for simulating biomolecular diffusion-reaction processes I: Finite element solutions 期刊论文
JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS, 2010, 卷号: 229, 期号: 19, 页码: 6979-6994
作者:  Lu, Benzhuo;  Holst, Michael J.;  McCammon, J. Andrew;  Zhou, Y. C.
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Electrodiffusion  Poisson-Nernst-Planck equations  Finite element  Singular charges  Molecular surface  Boundary condition  Conditioning