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Brief Survey of Biological Network Alignment and a Variant with Incorporation of Functional Annotations 期刊论文
CURRENT BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 4-10
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：182/0  |  提交时间：2019/04/02
Biological network  network alignment  gene ontology  alignment graph  optimization  
An effective sequence-alignment-free superpositioning of pairwise or multiple structures with missing data 期刊论文
Algorithms for Molecular Biology, 2016, 卷号: 11, 期号: 1
作者:  Lu,Jianbo;  Xu,Guoliang;  Zhang,Shihua;  Lu,Benzhuo
收藏  |  浏览/下载：133/0  |  提交时间：2018/07/30
Superposition  Protein structure alignment  Iterative closest point  
IIIDB: a database for isoform-isoform interactions and isoform network modules 期刊论文
BMC Genomics, 2015, 卷号: 16, 期号: Suppl 2
作者:  Tseng,Yu-Ting;  Li,Wenyuan;  Chen,Ching-Hsien;  Zhang,Shihua;  Chen,Jeremy JW;  Zhou,Xianghong Jasmine;  Liu,Chun-Chi
收藏  |  浏览/下载：142/0  |  提交时间：2018/07/30
Determining modular organization of protein interaction networks by maximizing modularity density 期刊论文
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2010, 卷号: 4, 页码: 12
作者:  Zhang, Shihua;  Ning, Xue-Mei;  Ding, Chris;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：142/0  |  提交时间：2018/07/30
Hubs with Network Motifs Organize Modularity Dynamically in the Protein-Protein Interaction Network of Yeast 期刊论文
PLOS ONE, 2007, 卷号: 2, 期号: 11, 页码: 9
作者:  Jin, Guangxu;  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：118/0  |  提交时间：2018/07/30
Revealing divergent evolution, identifying circular permutations and detecting active-sites by protein structure comparison 期刊论文
BMC STRUCTURAL BIOLOGY, 2006, 卷号: 6, 页码: 14
作者:  Chen, Luonan;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：129/0  |  提交时间：2018/07/30