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Joint reconstruction of cis-regulatory interaction networks across multiple tissues using single-cell chromatin accessibility data 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2021, 卷号: 22, 期号: 3, 页码: 15
作者:  Dong, Kangning;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：115/0  |  提交时间：2022/04/02
cis-regulatory interaction networks  single-cell ATAC-seq  Gaussian graphical LASSO  
Circular Trajectory Reconstruction Uncovers Cell-Cycle Progression and Regulatory Dynamics from Single-Cell Hi-C Maps 期刊论文
ADVANCED SCIENCE, 2019, 页码: 13
作者:  Ye, Yusen;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：274/0  |  提交时间：2020/01/10
cell cycle  chromosomal architectures  circular trajectory  dynamic structures  single-cell Hi-C maps  
MSTD: an efficient method for detecting multi-scale topological domains from symmetric and asymmetric 3D genomic maps 期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2019, 卷号: 47, 期号: 11, 页码: 11
作者:  Ye, Yusen;  Gao, Lin;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：159/0  |  提交时间：2020/01/10