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NetGen: a novel network-based probabilistic generative model for gene set functional enrichment analysis 期刊论文
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2017, 卷号: 11, 页码: 14
作者:  Sun, Duanchen;  Liu, Yinliang;  Zhang, Xiang-Sun;  Wu, Ling-Yun
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Gene ontology  Enrichment analysis  Network-based probabilistic generative model  Integer programming  Complex diseases  
Quantitative function and algorithm for community detection in bipartite networks 期刊论文
INFORMATION SCIENCES, 2016, 卷号: 367, 页码: 874-889
作者:  Li, Zhenping;  Wang, Rui-Sheng;  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：167/0  |  提交时间：2018/07/30
Bipartite network  Community  Quantitative function  Integer programming  Label propagation algorithm  
Identifying differentially expressed pathways via a mixed integer linear programming model 期刊论文
IET SYSTEMS BIOLOGY, 2009, 卷号: 3, 期号: 6, 页码: 475-486
作者:  Qiu, Y-Q.;  Zhang, S.;  Zhang, X. -S.;  Chen, L.
收藏  |  浏览/下载：88/0  |  提交时间：2018/07/30
Detecting drug targets with minimum side effects in metabolic networks 期刊论文
IET SYSTEMS BIOLOGY, 2009, 卷号: 3, 期号: 6, 页码: 523-533
作者:  Li, Z.;  Wang, R. -S.;  Zhang, X. -S.;  Chen, L.
收藏  |  浏览/下载：102/0  |  提交时间：2018/07/30
Exploring the constrained maximum edge-weight connected graph problem 期刊论文
ACTA MATHEMATICAE APPLICATAE SINICA-ENGLISH SERIES, 2009, 卷号: 25, 期号: 4, 页码: 697-708
作者:  Li, Zhen-ping;  Zhang, Shi-hua;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luo-nan
收藏  |  浏览/下载：124/0  |  提交时间：2018/07/30
connected subgraph  integer linear programming model  network flow  constraint Steiner network  maximum edge weight, heuristic algorithm  
Self-organizing map approaches for the haplotype assembly problem 期刊论文
MATHEMATICS AND COMPUTERS IN SIMULATION, 2009, 卷号: 79, 期号: 10, 页码: 3026-3037
作者:  Wu, Ling-Yun;  Li, Zhenping;  Wang, Rui-Sheng;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：144/0  |  提交时间：2018/07/30
SNP  Haplotype assembly  Minimum error correction  Self-organizing maps  Neural network  
exploringtheconstrainedmaximumedgeweightconnectedgraphproblem 期刊论文
actamathematicaeapplicataesinicaenglishseries, 2009, 卷号: 25, 期号: 4, 页码: 697
作者:  Zhenping Li;  Shihua Zhang;  XiangSun Zhang;  Luonan Chen
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Alignment of molecular networks by integer quadratic programming 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2007, 卷号: 23, 期号: 13, 页码: 1631-1639
作者:  Zhenping, Li;  Zhang, Shihua;  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：132/0  |  提交时间：2018/07/30
Capacitated facility location problem with general setup cost 期刊论文
COMPUTERS & OPERATIONS RESEARCH, 2006, 卷号: 33, 期号: 5, 页码: 1226-1241
作者:  Wu, LY;  Zhang, XS;  Zhang, JL
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facility location problem  Lagrangian heuristic  mixed integer programming