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Brief Survey of Biological Network Alignment and a Variant with Incorporation of Functional Annotations 期刊论文
CURRENT BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 4-10
作者:  Jing, Fang;  Zhang, Shao-Wu;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：179/0  |  提交时间：2019/04/02
Biological network  network alignment  gene ontology  alignment graph  optimization  
A Two-Stage Method to Identify Joint Modules From Matched MicroRNA and mRNA Expression Data 期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON NANOBIOSCIENCE, 2016, 卷号: 15, 期号: 4, 页码: 362-370
作者:  Min, Wenwen;  Liu, Juan;  Luo, Fei;  Zhang, Shihua
收藏  |  浏览/下载：164/0  |  提交时间：2018/07/30
L-0-penalized singular value decomposition (L-0-SVD)  miRNA cluster  miRNA-gene joint module  multiple-output sparse group lasso  
A novel computational framework for simultaneous integration of multiple types of genomic data to identify microRNA-gene regulatory modules 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2011, 卷号: 27, 期号: 13, 页码: I401-I409
作者:  Zhang, Shihua;  Li, Qingjiao;  Liu, Juan;  Zhou, Xianghong Jasmine
收藏  |  浏览/下载：146/0  |  提交时间：2018/07/30