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Detecting community structure: From parsimony to weighted parsimony 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2010, 卷号: 23, 期号: 5, 页码: 1024-1036
作者:  Zhang, Junhua;  Qiu, Yuqing;  Zhang, Xiang-Sun
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Cliques  community detection  complex networks  parsimony  
A linear programming model based on network flow for pathway inference 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2010, 卷号: 23, 期号: 5, 页码: 971-977
作者:  Ren, Xianwen;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：99/0  |  提交时间：2018/07/30
Gene expression  linear programming  network flow  pathway inference  protein interaction network  
Self-organizing map of complex networks for community detection 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2010, 卷号: 23, 期号: 5, 页码: 931-941
作者:  Li, Zhenping;  Wang, Ruisheng;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
收藏  |  浏览/下载：98/0  |  提交时间：2018/07/30
Community detection  complex network  neural networks  self-organizing map  
Editorial 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2010, 卷号: 23, 期号: 5, 页码: 883-883
作者:  Chen, Luonan;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：57/0  |  提交时间：2018/07/30
Determining modular organization of protein interaction networks by maximizing modularity density 期刊论文
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2010, 卷号: 4, 页码: 12
作者:  Zhang, Shihua;  Ning, Xue-Mei;  Ding, Chris;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：141/0  |  提交时间：2018/07/30
Predicting eukaryotic transcriptional cooperativity by Bayesian network integration of genome-wide data 期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2009, 卷号: 37, 期号: 18, 页码: 5943-5958
作者:  Wang, Yong;  Zhang, Xiang-Sun;  Xia, Yu
收藏  |  浏览/下载：129/0  |  提交时间：2018/07/30
Recognition of Structure Similarities in Proteins 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2008, 卷号: 21, 期号: 4, 页码: 665-675
作者:  Wang, Lin;  Qiu, Yuqing;  Wang, Jiguang;  Zhang, Xiangsun
收藏  |  浏览/下载：98/0  |  提交时间：2018/07/30
Binding site alignment  circular permutations  flexible alignment  protein structure alignment  protein structure retrieval  
Remarks on Network Community Properties 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMS SCIENCE & COMPLEXITY, 2008, 卷号: 21, 期号: 4, 页码: 637-644
作者:  Wang, Jiguang;  Qiu, Yuqing;  Wang, Ruisheng;  Zhang, Xiangsun
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Community  complex network  modularity  modularity density  
Predicting gene ontology functions from protein's regional surface structures 期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2007, 卷号: 8, 页码: 13
作者:  Liu, Zhi-Ping;  Wu, Ling-Yun;  Wang, Yong;  Chen, Luonan;  Zhang, Xiang-Sun
收藏  |  浏览/下载：160/0  |  提交时间：2018/07/30
Hubs with Network Motifs Organize Modularity Dynamically in the Protein-Protein Interaction Network of Yeast 期刊论文
PLOS ONE, 2007, 卷号: 2, 期号: 11, 页码: 9
作者:  Jin, Guangxu;  Zhang, Shihua;  Zhang, Xiang-Sun;  Chen, Luonan
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