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BiTSC2: Bayesian inference of tumor clonal tree by joint analysis of single-cell SNV and CNA data 期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 12
作者:  Chen, Ziwei;  Gong, Fuzhou;  Wan, Lin;  Ma, Liang
收藏  |  浏览/下载：159/0  |  提交时间：2022/06/21
single-cell DNA sequencing  intra-tumor heterogeneity  single nucleotide variation  copy number alteration  Bayesian modeling  cancer evolution  
MultiWaver 2.0: modeling discrete and continuous gene flow to reconstruct complex population admixtures 期刊论文
EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2019, 卷号: 27, 期号: 1, 页码: 133-139
作者:  Ni, Xumin;  Yuan, Kai;  Liu, Chang;  Feng, Qidi;  Tian, Lei;  Ma, Zhiming;  Xu, Shuhua
收藏  |  浏览/下载：263/0  |  提交时间：2019/03/05
MSIQ: JOINT MODELING OF MULTIPLE RNA-SEQ SAMPLES FOR ACCURATE ISOFORM QUANTIFICATION 期刊论文
ANNALS OF APPLIED STATISTICS, 2018, 卷号: 12, 期号: 1, 页码: 510-539
作者:  Li, Wei Vivian;  Zhao, Anqi;  Zhang, Shihua;  Li, Jingyi Jessica
收藏  |  浏览/下载：191/0  |  提交时间：2018/07/30
Isoform abundance estimation  joint inference from multiple samples  RNA sequencing  Bayesian hierarchical models  Gibbs sampling  data heterogeneity